الطرف الكاربوكسييلي هو آخر طرف في السلسلة الببتيدية الذي يعد آخر بقايا الحمض الأميني بمجموعة كربوكسيل COOH)-( حُرّة لتحدد نهاية سلسلة عديد الببتيد.