تنقية البروتين هي عملية فصل وتنقية بروتين معين من خليط من الجزيئات الحيوية. تتضمن هذه العملية عادةً عدة خطوات، بما في ذلك تحلل الخلايا، والتجزئة، واستخدام كواشف متخصصة وقِياسُ الطَّيْفِ الضَوئِي (Spectrophotometry).