تسلسل جينوم البكتيريا هي كائنات حية وحيدة الخلية ذات جينومات دائرية يتم تخزينها عادةً في كروموسوم واحد. يبلغ طول جينوم بكتيريا الإشريكية القولونية (E. coli) حوالي 4.6 مليون زوج قاعدي ويحتوي على أكثر من 4200 جين.